Betalnings-gateways kan fungera på tre olika sätt:

1. Allt hanteras externt: Kunderna dirigeras om från handlarens webbplats till betalnings-gatewayens webbplats. När betalningen är genomförd dirigeras kunden tillbaka till handlarens webbplats och rätt steg i betalningsprocessen.
2. Betalningsuppgifter hanteras lokalt, betalning externt: Kunden anger sina betalningsuppgifter på handlarens webbplats och sedan skickas uppgifterna vidare till betalnings-gatewayen utan att kunden ser det. Själva betalningen hanteras på betalnings-gatewayens webbplats.
3. Allt hanteras lokalt: Handlaren tar både in och behandlar betalningen på platsen. Det här passar bäst för stora företag, eftersom det oftast är tekniskt komplicerat och kräver mycket underhåll.